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根系生長在堅硬土層內的分布較淺；生長在疏松的土壤內的分布較深。
獼猴桃為肉質根，根皮率高達30%～50%；根含水量高，一年生根的含水量為84%，二年生根的含水量為79%，獼猴桃主根不發達，側根和須根發達。獼猴桃根系分布淺而廣。活土層的厚度，以及溫度、水分、空氣、養分是影響根系生長的主要因子。一般在40～80厘米深的土層中分布多。成年樹根群體的分布范圍約為樹冠的3倍。
根系獼猴桃骨干根較一般果樹少，但根的導管發達，根壓大，根系受傷之后，再生能力強。成年獼猴桃有50%以上的總根系長度位于30～50厘米深的表土層，90%以上根系位于1米范圍內。幼年獼猴桃樹的根系呈“碗形”分布，且根長度密度隨深度和離樹干的距離而減少。而成年樹，根長度密度隨深度而減小，但并不受離樹干距離的遠近影響。獼猴桃根系的年生長期比枝條生長期長，每年有30%以上的根系被更新。
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